Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms