Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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RAB11FIP4Q86YS3 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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RAB11FIP4Q86YS3 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP4Q86YS3 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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RAB11FIP4Q86YS3 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP4Q86YS3 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB11FIP4Q86YS3 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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RAB11FIP4Q86YS3 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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RAB11FIP4Q86YS3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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RAB11FIP4Q86YS3 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP4Q86YS3 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP4Q86YS3 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP4Q86YS3 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
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RAB11FIP4Q86YS3 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP4Q86YS3 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP4Q86YS3 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP4Q86YS3 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP4Q86YS3 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP4Q86YS3 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP4Q86YS3 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP4Q86YS3 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP4Q86YS3 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP4Q86YS3 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP4Q86YS3 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP4Q86YS3 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP4Q86YS3 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP4Q86YS3 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP4Q86YS3 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP4Q86YS3 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP4Q86YS3 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB11FIP4Q86YS3 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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