Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms