Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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