Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.1 ms