Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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