Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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