Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPRCAPQ14761 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms