Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms