Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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