Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP4P49662 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP4P49662 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP4P49662 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP4P49662 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP4P49662 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP4P49662 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP4P49662 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP4P49662 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP4P49662 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP4P49662 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP4P49662 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP4P49662 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms