Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SSR1P43307 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSR1P43307 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSR1P43307 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSR1P43307 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSR1P43307 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSR1P43307 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSR1P43307 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSR1P43307 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SSR1P43307 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSR1P43307 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSR1P43307 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSR1P43307 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSR1P43307 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSR1P43307 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSR1P43307 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSR1P43307 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSR1P43307 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSR1P43307 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSR1P43307 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSR1P43307 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSR1P43307 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSR1P43307 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSR1P43307 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSR1P43307 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSR1P43307 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSR1P43307 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSR1P43307 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSR1P43307 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSR1P43307 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSR1P43307 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSR1P43307 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSR1P43307 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSR1P43307 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSR1P43307 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSR1P43307 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSR1P43307 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSR1P43307 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSR1P43307 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSR1P43307 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSR1P43307 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SSR1P43307 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSR1P43307 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSR1P43307 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSR1P43307 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSR1P43307 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSR1P43307 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSR1P43307 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSR1P43307 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSR1P43307 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSR1P43307 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSR1P43307 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms