Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms