Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms