Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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HOXD12P35452 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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HOXD12P35452 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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