Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TSPOP30536 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TSPOP30536 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TSPOP30536 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TSPOP30536 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TSPOP30536 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TSPOP30536 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TSPOP30536 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TSPOP30536 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TSPOP30536 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TSPOP30536 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TSPOP30536 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TSPOP30536 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TSPOP30536 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TSPOP30536 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TSPOP30536 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TSPOP30536 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TSPOP30536 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TSPOP30536 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TSPOP30536 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TSPOP30536 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TSPOP30536 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TSPOP30536 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TSPOP30536 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TSPOP30536 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TSPOP30536 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TSPOP30536 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TSPOP30536 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TSPOP30536 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TSPOP30536 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TSPOP30536 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TSPOP30536 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TSPOP30536 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TSPOP30536 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TSPOP30536 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TSPOP30536 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TSPOP30536 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TSPOP30536 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
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