Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ECHS1P30084 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ECHS1P30084 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ECHS1P30084 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ECHS1P30084 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ECHS1P30084 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ECHS1P30084 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ECHS1P30084 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ECHS1P30084 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ECHS1P30084 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ECHS1P30084 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ECHS1P30084 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ECHS1P30084 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ECHS1P30084 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ECHS1P30084 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ECHS1P30084 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ECHS1P30084 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ECHS1P30084 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ECHS1P30084 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ECHS1P30084 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ECHS1P30084 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ECHS1P30084 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ECHS1P30084 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ECHS1P30084 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ECHS1P30084 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ECHS1P30084 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ECHS1P30084 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ECHS1P30084 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ECHS1P30084 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ECHS1P30084 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ECHS1P30084 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ECHS1P30084 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ECHS1P30084 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ECHS1P30084 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ECHS1P30084 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ECHS1P30084 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ECHS1P30084 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ECHS1P30084 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ECHS1P30084 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ECHS1P30084 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ECHS1P30084 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ECHS1P30084 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ECHS1P30084 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ECHS1P30084 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ECHS1P30084 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ECHS1P30084 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ECHS1P30084 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ECHS1P30084 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ECHS1P30084 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ECHS1P30084 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ECHS1P30084 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ECHS1P30084 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ECHS1P30084 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ECHS1P30084 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ECHS1P30084 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ECHS1P30084 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ECHS1P30084 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ECHS1P30084 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ECHS1P30084 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ECHS1P30084 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ECHS1P30084 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms