Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 MAP1A-201ENST00000300231 10258 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 CNTNAP2-201ENST00000361727 9896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GCSHP23434 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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GCSHP23434 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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GCSHP23434 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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GCSHP23434 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 RAP1GAP2-201ENST00000254695 6661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 DNM3-208ENST00000627582 7625 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 TIAM1-206ENST00000541036 7018 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GCSHP23434 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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