Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PGA3P0DJD8 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms