Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms