Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201.8 ms