Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms