Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RTKNQ9BST9 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms