Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF1Q9BQI6 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms