Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms