Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126 ms