Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms