Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms