Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 HNRNPABP1-201ENST00000406003 734 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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