Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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SGCAQ16586 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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SGCAQ16586 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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SGCAQ16586 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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SGCAQ16586 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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SGCAQ16586 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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SGCAQ16586 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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