Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms