Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms