Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IHHQ14623 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IHHQ14623 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IHHQ14623 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IHHQ14623 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IHHQ14623 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IHHQ14623 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IHHQ14623 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IHHQ14623 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IHHQ14623 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IHHQ14623 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IHHQ14623 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IHHQ14623 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IHHQ14623 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IHHQ14623 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IHHQ14623 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IHHQ14623 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IHHQ14623 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IHHQ14623 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IHHQ14623 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IHHQ14623 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IHHQ14623 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IHHQ14623 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IHHQ14623 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IHHQ14623 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IHHQ14623 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IHHQ14623 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
IHHQ14623 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IHHQ14623 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IHHQ14623 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IHHQ14623 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IHHQ14623 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IHHQ14623 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
IHHQ14623 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IHHQ14623 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IHHQ14623 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
IHHQ14623 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IHHQ14623 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IHHQ14623 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IHHQ14623 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IHHQ14623 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IHHQ14623 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IHHQ14623 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IHHQ14623 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IHHQ14623 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IHHQ14623 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IHHQ14623 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms