Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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