Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms