Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
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TCIRG1Q13488 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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TCIRG1Q13488 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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TCIRG1Q13488 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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TCIRG1Q13488 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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TCIRG1Q13488 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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TCIRG1Q13488 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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TCIRG1Q13488 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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