Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 PLEKHA2-207ENST00000616834 3594 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 AL583810.2-201ENST00000556430 3254 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 TMPRSS13-205ENST00000526090 2592 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms