Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4BQ07343 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PDE4BQ07343 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PDE4BQ07343 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PDE4BQ07343 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4BQ07343 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4BQ07343 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4BQ07343 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4BQ07343 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4BQ07343 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4BQ07343 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4BQ07343 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4BQ07343 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4BQ07343 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4BQ07343 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4BQ07343 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4BQ07343 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4BQ07343 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4BQ07343 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4BQ07343 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4BQ07343 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4BQ07343 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4BQ07343 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4BQ07343 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4BQ07343 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4BQ07343 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4BQ07343 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4BQ07343 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4BQ07343 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4BQ07343 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4BQ07343 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4BQ07343 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4BQ07343 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4BQ07343 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4BQ07343 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4BQ07343 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4BQ07343 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms