Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms