Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 POLR1D-206ENST00000489647 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 MEG8-220ENST00000636052 1369 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 MMP26-202ENST00000380390 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AL121983.2-201ENST00000426899 688 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 ARHGEF19-AS1-201ENST00000457809 439 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 CREM-237ENST00000488328 1049 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms