Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms