Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMF1P82094 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMF1P82094 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMF1P82094 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMF1P82094 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMF1P82094 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMF1P82094 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMF1P82094 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMF1P82094 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMF1P82094 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMF1P82094 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMF1P82094 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMF1P82094 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMF1P82094 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMF1P82094 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMF1P82094 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMF1P82094 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMF1P82094 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TMF1P82094 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMF1P82094 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMF1P82094 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMF1P82094 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TMF1P82094 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TMF1P82094 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMF1P82094 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMF1P82094 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMF1P82094 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMF1P82094 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMF1P82094 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMF1P82094 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMF1P82094 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMF1P82094 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMF1P82094 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMF1P82094 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMF1P82094 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMF1P82094 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMF1P82094 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMF1P82094 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMF1P82094 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMF1P82094 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMF1P82094 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMF1P82094 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMF1P82094 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms