Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNA2P51530 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.8 ms