Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF6P49848 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms