Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTGS1P23219 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms