Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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