Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms