Protein–RNA interactions for Protein: O95196

CSPG5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, humanhuman

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG5O95196 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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