Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB3O43889 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB3O43889 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB3O43889 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB3O43889 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB3O43889 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB3O43889 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB3O43889 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB3O43889 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB3O43889 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB3O43889 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB3O43889 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB3O43889 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB3O43889 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB3O43889 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB3O43889 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB3O43889 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB3O43889 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms