Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms